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ASMS布魯克總裁專訪:timsTOF Ultra 開啟蛋白質組學新篇章

2023.6.30

【導讀】 以每6個月進行一代創(chuàng)新的速度,布魯克自推出timsTOF以來,不斷刷新多組學研究的記錄,并毫無意外地在每年ASMS上,為廣大的粉絲和用戶們奉上新的力作。在今年第71屆ASMS大會上,布魯克宣布推出新的timsTOF Ultra質譜儀,再一次刷新蛋白質組學的靈敏度、覆蓋率和深度。分析測試百科網采訪了布魯克生命科學質譜總裁 Rohan Thakur博士,他將帶我們一覽新產品的特點,和timsTOF系列已取得的應用創(chuàng)新,希望對多組學和質譜的專家和用戶有幫助。

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布魯克生命科學質譜總裁 Rohan Thakur博士(左一),布魯克生命科學質譜全球市場營銷總監(jiān) Petra Scheffer博士(左二),布魯克生命科學質譜大中華區(qū)商務經理何磊(右一),分析測試百科網總經理卞利萍(右二)

timsTOF Ultra開啟單細胞蛋白質組學新篇章


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布魯克timsTOF Ultra

談及本屆展會的主打新品timsTOF Ultra,Rohan博士介紹道:“我認為它是當今靈敏度最高的質譜,因其具有革命性的SCP(單細胞蛋白質組)組件。timsTOF Ultra能夠在單細胞靈敏度(0.125ng)下鑒定 >5,000個蛋白質和 >55,000條多肽,且擁有高置信度(FDR<1%)。其特點在單細胞蛋白質組學和免疫肽組學上更起作用,并且直接在腫瘤學研究中可以看到低水平的肽。這是我們在今年展會上最值得驕傲的產品?!?/span>

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超低上樣量下的超高靈敏度。在結合 nanoElute??2 的 timsTOF Ultra 平臺上,采用 IonOpticks Aurora 625px 色譜柱在 22分鐘色譜梯度,只需 125pg 細胞消化液,即可鑒定超過 5528 種蛋白和 55000 條肽段,展示其對珍貴樣本具有無與倫比的鑒定深度和靈敏度。

timsTOF Ultra的硬件創(chuàng)新包括:新的具有更大口徑毛細管和優(yōu)化渦流氣流的捕獲噴霧離子源(CaptiveSpray Ultra?)、第4代TIMS(捕集離子淌度)XR淌度池和14位數模轉換器。timsTOF Ultra可以在0.125ng進樣量的單細胞水平上鑒定超過55000條肽段,對應超過5000種蛋白質鑒定(FDR<1%),低于1ng蛋白進樣量的突破性靈敏度和定量性能為蛋白質組學研究建立了一個新標準。timsTOF Ultra擁有無與倫比的靈敏度,加上timsTOF平臺的穩(wěn)定性,以及高達300Hz的PASEF? MS/MS掃描速度,為超低樣品量的應用提供了顯著的性能改進,包括無偏的單細胞蛋白質組學和單細胞脂質組學、無偏的空間蛋白質組學、免疫肽組學、磷酸化蛋白質組學、PTM分析和蛋白質相互作用(PPI)研究。

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CaptiveSpray 電離技術:在 Taylor 錐周圍形成漩渦,無需調整噴針位置并通過聚焦集中霧化氣,渦旋氣流完美包圍噴霧錐,更大限度提高離子傳輸效率,獲得納升流速下更高靈敏度。在整個液相梯度中保持穩(wěn)定噴霧,確保結果穩(wěn)定性和可靠性。

Rohan表示,在用戶會上,很多免疫肽組學的研究者給與了積極的反饋,由于timsTOF Ultra的高靈敏度,使得較小的腫瘤樣本的存在有了意義,人們不是僅看市場數據,而是通過對腫瘤樣本進行真實的分析,感受到了布魯克單細胞蛋白質組學分析工具的強大。如奧地利維也納生物中心分子病理學研究所蛋白質組學技術中心主任Karl Mechtler教授說:“?我清楚地了解異質組織的復雜性。為了真正理解細胞機制和疾病,區(qū)分不同細胞類型至關重要。盡管單細胞分析已經改變了游戲規(guī)則,我們在最大限度地解決其潛在通量和可分析的蛋白質方面面臨挑戰(zhàn)。在單細胞實驗中檢測 6000 種或者更多的蛋白質是有生物學意義的。timsTOF Ultra 克服了這些挑戰(zhàn),使我們能夠以無與倫比的速度和靈敏度探索單個細胞的蛋白質組。得益于 timsTOF Ultra,單細胞分析達到了新的高度,我很高興看到這一突破將我們帶向下一步的探索?!?/p>

推動多組學研究方法革新


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布魯克timsTOF HT

談及去年發(fā)布的新產品的情況,Rohan博士介紹道:“自2016年推出業(yè)界最高淌度分辨的timsTOF質譜后,從蛋白質組學拓展到代謝組學、再到單細胞組學領域,布魯克不斷優(yōu)化創(chuàng)新。timsTOF HT擴展了儀器性能,具有更高通量,支持更大體積的上樣,可以鑒定出更多的蛋白。timsTOF fleX裝配MALDI源,開創(chuàng)了空間蛋白質組學的新領域,可以看到空間中蛋白質及單細胞的變化,布魯克是極少數能做到這一點的公司。今年發(fā)布的timsTOF Ultra樹立了單細胞蛋白質組學的新標桿:更高靈敏度、更高覆蓋率、鑒定更多的蛋白和多肽。Sierra SPR?-32 Pro專門用于高通量藥物靶標篩查,布魯克在歐洲、美洲、亞洲,在各行各業(yè)已有廣泛的用戶群體。

timsTOF HT代表性的一個客戶是Enveda,Enveda聚焦在天然產物分析領域,建立數據為導向的方法,篩選、驗證和開發(fā)高潛力的天然化合物。天然產物類似于中國的中藥,他們正在使用timsTOF HT 發(fā)展先進的方法,篩選數百萬種化合物,看看它如何影響不同的表型。我們非常期待能夠從Enveda的工作中學到有用的知識,并在未來能夠應用到中國的傳統中藥行業(yè)?!?/p>

構建完整的生態(tài)系統


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布魯克timsTOF fleX MALDI-2

??????? 談及市場應對策略和活動,Rohan博士說:“我們聚焦的行業(yè)如生物技術和癌癥研究,包括學術界腫瘤學研究,藥物界的腫瘤學研究,生物技術的腫瘤學研究等,這些領域都需要高靈敏度的支持才能開展深入研究。布魯克是一家質譜公司,我們所做的就是讓客戶更成功,為此我們正在構建一個完整的生態(tài)系統。布魯克投資樣品前處理領域,比如現在和一家叫做PreOmics的公司合作,推出組織處理、樣品凈化等解決方案。當前樣品數量在增加,但樣品的體積在減小,這需要更好的前處理能力??蛻魝冃枰獦悠奉A處理系統、分離系統、檢測系統、數據分析軟件等,過去布魯克只提供質譜,現在向客戶提供所有精密的儀器和完整解決方案,幫助他們能夠從儀器中獲取最大收益,這是非常成功的,今年可以看到布魯克展臺上有各式各樣的配件,這是去年所沒有的,這些絕佳的配件使整套分析系統的工作更流暢、更簡單?!?/p>

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PreOmics的BeatBox 以簡單、快速且易于使用的形式提供組織均質化,并且可以在 10 分鐘內從 1-5 mg 組織中處理多達 96 個組織樣本,而不會產生交叉污染

布魯克去年收購的Pepsep,專注于納升流色譜柱、專用噴霧針和相關配件以優(yōu)化納升流蛋白質組學工作流程,其技術具有特殊的Frit模塊,使用戶更換柱子的時候不需要移動納流噴霧針尖,在高度復雜的實驗中極其好用,非常適用于CRO實驗室和大學的中心實驗室。任何人都可以更換柱子,并且不影響納升噴霧的性能。

布魯克未來還將推出基于人工智能AI的算法軟件,TIMScore? 現在用將機器學習用于支持CCS的算法,使搜索引擎能夠提供更大范圍的肽和蛋白質識別,同時控制嚴格的錯誤率(FDR)。數十萬個實驗數據點被用于訓練ML算法,該算法可以準確預測胰蛋白酶和磷酸化肽的CCS值。此外,中國的中國科學院上海有機化學研究所生物與化學交叉中心的朱正江研究員正在timsTOF上應用機器學習方法構建CCS值的數據庫,我們期待他未來做出更杰出的工作。

布魯克中國


談到布魯克中國的發(fā)展,Rohan高度評價了何磊總經理帶領下的布魯克中國團隊,中國團隊展現了卓越的專業(yè)素養(yǎng)和出色的執(zhí)行能力。他們以勤奮、創(chuàng)新和團結的精神,為布魯克公司在中國的發(fā)展取得了巨大的成功,timsTOF在中國的銷售提升了3倍。在客戶服務方面,中國團隊及時將前沿技術傳遞給客戶,提供了及時、專業(yè)的響應和支持,能夠迅速分析客戶遇到的技術問題,提供高效的解決方案。他們不僅解決客戶的困難,還主動分享技術經驗和最佳實踐,提高客戶的技術水平,助力客戶獲得更大的成功。

創(chuàng)新驅動 探索邊界


Rohan博士最后說道:“布魯克公司的策略是每6個月進行一輪創(chuàng)新,創(chuàng)新的速度非???,并不斷探索科學的邊界。布魯克瞄準的是高度創(chuàng)新的儀器,而不是普通常規(guī)的設備。科學家們需要最新的產品來滿足他們的研究需求,一旦我們推出了突破性的產品,我們希望全球各地的科學家、醫(yī)生、患者們均能盡早受益?!?/p>

關于布魯克公司(納斯達克股票代碼:BRKR)


布魯克致力于讓科學家能夠取得突破性發(fā)現,并開發(fā)新的應用以提高人類生活質量。布魯克的高性能科學儀器和高價值的分析和診斷解決方案使科學家能夠探索分子、細胞和微觀層面的生命和材料。

憑借與客戶的密切合作,布魯克在生命科學分子研究、應用和制藥應用以及顯微鏡、納米分析和工業(yè)應用等領域實現了創(chuàng)新突破和生產力提升,并創(chuàng)造了諸多客戶成功案例。近年來,布魯克也成為細胞生物學、臨床前成像、臨床影像學和蛋白質組學研究、臨床微生物學和分子病理學研究的高性能系統的提供者。

如今,布魯克分布在全球的 7500 多名員工正在各大洲的 90 多個工作地應對這一長期挑戰(zhàn)。布魯克堅持以其廣泛的產品和解決方案以及廣泛的安裝系統基礎在客戶中享有盛譽。作為世界領先的分析儀器公司之一,布魯克致力于進一步充分滿足客戶需求,并不斷為當今的分析研究工作開發(fā)先進的技術和創(chuàng)新的解決方案。

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