????蛋白質(zhì)作為功能的直接行使者,已經(jīng)被科研工作這廣泛應用于不同領(lǐng)域中,目前蛋白組學有很多優(yōu)秀的科研成果,在各個領(lǐng)域及期刊上發(fā)表,其中也不乏CNS在內(nèi)的頂級期刊。那我們的蛋白組學文章可以投哪些期刊呢?了解已發(fā)表文章的情況可以幫助我們很好的解決這個問題。這里,我們以“Proteomics”為關(guān)鍵詞,共搜索到155,429篇文章,隨機選取了2017-2021年共60,474篇文章中的10,000篇,針對蛋白組學進行整體分析(第1,2,4節(jié));同時,以“Proteomics”及各領(lǐng)域關(guān)鍵詞聯(lián)合搜索,對不同研究領(lǐng)域進行分析(第3節(jié))。最終獲取蛋白組領(lǐng)域的系統(tǒng)信息,希望對蛋白組學文章投稿有所助益。(本文分析基于從總體中隨機抽取的一定數(shù)量文章,因此內(nèi)容僅供參考)
1. 文章概述
????首先對搜索到的文章進行時間維度的統(tǒng)計,從近10年來看,蛋白組學文章發(fā)文數(shù)量呈逐漸增加的趨勢,整體上研究仍然火熱。
圖1 近10年蛋白組學文章發(fā)表數(shù)
????接著以2017-2021近5年數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),隨機提取其中的10000篇文章,對蛋白組學發(fā)文期刊進行統(tǒng)計。發(fā)表文章數(shù)量大于50篇的期刊共23個,總計3695篇文章,平均IF=5.43,中位IF=4.379。發(fā)表最多的期刊是JPR (Journal of Proteome research),MMB(Methods in Molecular Biology),JP (Journal of Proteomics),Proteomics,MCP (Molecular & Cellular Proteomics)等,排名前幾的期刊基本都是蛋白領(lǐng)域主流雜志,但相對而言影響因子大都不是很高。
圖2 發(fā)表50篇以上蛋白組學文章的期刊
2. 文章發(fā)表期刊IF區(qū)間分布
在提取的10000篇文章中,對發(fā)文數(shù)目大于等于20篇的期刊IF區(qū)間進行統(tǒng)計,可以看到,整體上影響因子主要還是集中在0-5分,占57.97%,其次為5-10分,占比34.46%,10分以上多為一些綜合期刊。
圖3 文章發(fā)表期刊IF區(qū)間
3. 部分研究領(lǐng)域蛋白組學文章發(fā)表情況
以“cancer”為癌癥關(guān)鍵詞,對2017-2021年發(fā)表的蛋白組學文章進行查詢,共查詢到14903篇文章,不同年份發(fā)表情況整體上穩(wěn)定增加。
圖4 2017-2021癌癥相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)
對發(fā)文量前20的期刊進行統(tǒng)計,排名靠前的仍以蛋白組學主流期刊以及組學綜合期刊為主,平均影響因子IF=7.632,中位IF=6.281。
圖5 2017-2021癌癥相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)前20期刊
以“Diabetes”為糖尿病關(guān)鍵詞,對2017-2021年發(fā)表的蛋白組學文章進行查詢,共查詢到2211篇文章,不同年份發(fā)表情況整體上逐年增加,2020年有較大增長。
圖6 2017-2021糖尿病相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)
對發(fā)文量前20的期刊進行統(tǒng)計,以蛋白組學主流期刊,綜合期刊,以及糖尿病領(lǐng)域期刊為主,平均影響因子IF=7.349,中位IF=5.501。
圖7 2017-2021糖尿病相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)前20期刊
以“cardiovascular diseases”為心血管疾病關(guān)鍵詞,對2017-2021年發(fā)表的蛋白組學文章進行查詢,共查詢到2565篇文章,2017-2021年間發(fā)文數(shù)量相差不大,基本在400篇以上。
圖8 2017-2021心血管疾病相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)
對發(fā)文量前20的期刊進行統(tǒng)計,期刊以蛋白組學主流期刊,心血管主流期刊,綜合期刊為主,同時含Circulation research,JACC等心血管領(lǐng)域頂級期刊,平均影響因子IF=9.213,中位IF=5.406。
圖9 2017-2021心血管疾病相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)前20期刊
以“plant”為植物關(guān)鍵詞,對2017-2021年發(fā)表的文章進行查詢,共查詢到6454篇文章,不同年份發(fā)表情況整體上也逐年增加。
圖10 2017-2021植物相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)
對發(fā)文量前20的期刊進行統(tǒng)計,以蛋白質(zhì)組學主流期刊,植物領(lǐng)域期刊為主,平均影響因子IF=5.416,中位IF=4.845。
圖11 2017-2021植物相關(guān)蛋白組學文章發(fā)表數(shù)前20期刊
4. 不同IF區(qū)間期刊
2017-2021年近5年提取的10000篇文章中,發(fā)表蛋白組文章數(shù)大于等于20篇的期刊IF區(qū)間統(tǒng)計詳細列表可以參照下表,參照雜志影響因子及發(fā)文數(shù)目,可以對投稿提供很好的參考價值。
5. 投稿建議及評述
目前蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域主流的雜志 MCP (Molecular & Cellular Proteomics),JPR (Journal of Proteome research),JP (Journal of Proteomics),Proteomics等對于大規(guī)模蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)的嚴謹性都有非常高的要求,并且都要求在正文或者補充數(shù)據(jù)中寫明實驗設(shè)計以及數(shù)據(jù)分析的細節(jié)。而新穎的選題,嚴謹?shù)膶嶒炘O(shè)計以及更全面的分子機制和功能驗證等都是蛋白組學研究發(fā)文的關(guān)鍵因素,下面對一些具體的期刊分三檔進行一個簡單介紹。
1)第一檔期刊(影響因子10分以上)
組學期刊:Molecular Systems Biology,Nature Genetics等。
綜合性期刊:cell,Nature,Science,Nature Communications,PNAS,Molecular Cell,Cell Research等。
組學思路:在這類高水平期刊中,組學驅(qū)動的研究主要包括:
1.大隊列研究,篩選臨床生物標志物。
2. 組學+目的基因后續(xù)深入、完整的功能機制研究。
3.大樣本多組學或多樣本類型多組學,大數(shù)據(jù)分析。
2)第二檔期刊(影響因子5~10分)
組學期刊:Genomics Proteomics and Bioinformatics (GPB),Molecular & Cellular Proteomics(MCP)等
綜合期刊:Cell Reports,F(xiàn)rontiers in Microbiology,mSystems,Scientific Data等。
組學思路:這類文章除了單純的組學數(shù)據(jù)分析外,比第三類期刊內(nèi)容更豐富。通常要求大數(shù)據(jù)集,或數(shù)據(jù)分析完整性以及進一步功能驗證及機制研究。
3)第三檔期刊(影響因子5分以下)
組學期刊:BMC Genomics,Proteomics,Journal of Proteomics,Journal of Proteome Research等。
綜合期刊:PLoS One等。
組學思路:這類文章一般是最常見也是最簡單的組學研究思路。
1. 蛋白質(zhì)組學方向:組學+差異蛋白WB或PRM驗證。
2.蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學方向:則以修飾組學數(shù)據(jù)分析為主。