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T/SHZSAQS 016-2020
綿羊雙肌表型主效基因mstn分子檢測(cè)技術(shù)規(guī)程

Technical regulations for molecular detection of the main effect gene mstn of sheep double muscle phenotype


技術(shù)規(guī)程核心解讀

本標(biāo)準(zhǔn)針對(duì)綿羊mstn基因3'UTR區(qū)G6223A突變建立的分子檢測(cè)體系,通過(guò)SSCP(單鏈構(gòu)象多態(tài)性)技術(shù)實(shí)現(xiàn)基因分型,為雙肌表型選育提供分子依據(jù)。


關(guān)鍵技術(shù)對(duì)比

檢測(cè)維度 傳統(tǒng)方法 本規(guī)程方法
靈敏度 需>5%突變頻率 可檢測(cè)1%低頻突變
通量 單樣本檢測(cè) 96孔板批量處理
成本 測(cè)序(¥150/樣) 電泳檢測(cè)(¥20/樣)

標(biāo)準(zhǔn)實(shí)施要點(diǎn)

樣本處理規(guī)范

采用ACD抗凝劑(檸檬酸:檸檬酸鈉:葡萄糖=0.48:1.32:1.47)保存血液樣本,防止DNA降解。實(shí)驗(yàn)證明該配比可使DNA提取效率提升23.7%。

關(guān)鍵試劑配制

  • 30%丙烯酰胺需37℃溶解,避免高溫導(dǎo)致交聯(lián)劑分解
  • 顯影液中甲醛濃度嚴(yán)格控制在2.5mL/500mL,過(guò)量會(huì)導(dǎo)致背景過(guò)深

技術(shù)演進(jìn)分析

該標(biāo)準(zhǔn)基于2002年Beltex綿羊突變發(fā)現(xiàn),通過(guò)優(yōu)化:

  1. 退火溫度從52℃調(diào)整為50.5℃,提高引物結(jié)合特異性
  2. 銀染時(shí)間縮短至20分鐘,較傳統(tǒng)方法效率提升40%
  3. 建立三級(jí)判讀標(biāo)準(zhǔn)(GG/GA/AA),準(zhǔn)確率達(dá)99.2%

實(shí)施建議

質(zhì)量控制節(jié)點(diǎn)

DNA純度 OD260/280值<1.7時(shí)需重新酚抽提
電泳條件 8%凝膠在150V恒壓電泳效果最佳

常見(jiàn)問(wèn)題處理

若SSCP出現(xiàn)額外條帶,可能原因:
1) 樣品變性不充分——確保98℃變性10min后立即冰浴
2) 凝膠聚合不均——TEMED加入后需在30min內(nèi)灌膠

 

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T/SHZSAQS 016-2020

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標(biāo)準(zhǔn)號(hào)
T/SHZSAQS 016-2020
發(fā)布
2020年
總頁(yè)數(shù)
9頁(yè)
發(fā)布單位
中國(guó)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)
當(dāng)前最新
T/SHZSAQS 016-2020
 
 

本規(guī)程規(guī)定了綿羊雙肌表型主效基因mstn的分子檢測(cè)方法。 本規(guī)程適用于綿羊雙肌表型主效基因mstn的分子檢測(cè)。


T/SHZSAQS 016-2020 中可能用到的儀器設(shè)備


專(zhuān)題


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