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SN/T 4877.9-2017
基因條形碼篩查方法 第9部分:檢疫性腥黑粉菌

Genetic barcode screening method Part 9: Quarantine Ustilagospora

SNT4877.9-2017, SN4877.9-2017


標準號
SN/T 4877.9-2017
別名
SNT4877.9-2017, SN4877.9-2017
發(fā)布
2017年
總頁數(shù)
10頁
發(fā)布單位
國家質(zhì)檢總局
當前最新
SN/T 4877.9-2017
 
 
引用標準
GB/T 18085 GB/T 28080
適用范圍
SN/T 4877 的本部分規(guī)定了小麥印度腥黑穗病菌 Tilletia indica 和小麥矮化腥黑穗病菌 Tilletia contraversa 的 DNA 條形碼篩查中序列的擴增、分析及結(jié)果判定等。本部分適用于小麥印度腥黑穗病菌和小麥矮化腥黑穗病菌的篩查。
術(shù)語描述
DNA 條形碼
DNA barcode
生物體內(nèi)能夠代表該物種的,標準的、有足夠變異的、易擴增且相對較短的 DNA 片段。
內(nèi)部間隔轉(zhuǎn)錄區(qū)序列
internal transcribed spacer (ITS)
在真核生物中,核糖體 DNA 是由核糖體基因及與之相鄰的間隔區(qū)組成,其基因組序列從 5’到 3’依次為:外部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)、18S 基因、內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū) 1(ITS1)、5.8S 基因、內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū) 2(ITS2)、28S 基因和基因間隔序列。
內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)
internal transcribed spacer (ITS)
存在于 18S rDNA、5.8S rDNA 和 28S rDNA 之間的區(qū)域,ITS1 和 ITS2 作為非編碼區(qū),受外界環(huán)境因素的影響較小,與編碼區(qū)域相比具有進化速度快的特點,在種內(nèi)的不同菌株之間高度保守,而在真菌種間存在極大的變化,表現(xiàn)出極大的序列多態(tài)性,能夠提供詳盡的系統(tǒng)學分析所需的可遺傳性狀。
檢疫性病菌
quarantine pathogen
指對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)或生態(tài)環(huán)境構(gòu)成威脅,需要采取檢疫措施以防止傳播的病原生物。
序列相似度
sequence similarity
指兩個 DNA 序列之間匹配的堿基對比例,用于判斷兩個序列的親緣關(guān)系。

SN/T 4877.9-2017 中提到的儀器設(shè)備

超凈工作臺
用于提供無菌操作環(huán)境,防止樣品污染。

組合式PCR工作臺

君勒鉑 DL-PCR80V/DL-PCR8OVT DL-PCR120V/DL-PCR120VT

超凈工作臺

培英 BCL-1360A

系列超凈工作臺

培英 RB-CJ-2N(D)

PCR 擴增儀
用于進行聚合酶鏈式反應,擴增特定 DNA 序列。
搖床
用于培養(yǎng)微生物或細胞等樣品。
核酸蛋白分析儀
用于測定 DNA 的純度與濃度。

專題


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