布魯克與景杰生物聯(lián)合 推動前沿單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究
分析測試百科網(wǎng)訊 2021年10月14日,在第十一屆中國蛋白質(zhì)組學(xué)大會召開期間,為推動單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展,拓展單細胞研究的視野,布魯克和景杰生物聯(lián)合舉辦了“單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)專題衛(wèi)星會”,并在線上進行了直播。
衛(wèi)星會現(xiàn)場
布魯克.道爾頓中國區(qū)經(jīng)理何磊先生
布魯克.道爾頓中國區(qū)經(jīng)理何磊先生首先致歡迎辭,他說,來到單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)衛(wèi)星會的專業(yè)聽眾如此眾多,遠遠超出預(yù)期,布魯克將不負大家的期望,為大家?guī)砭实膱蟾婧透玫募夹g(shù),也非常感謝一直以來的合作單位景杰生物和著名的丁顯廷教授,他們也將為大家?guī)砭实膱蟾妗?/p>
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布魯克.道爾頓中國區(qū)蛋白質(zhì)組學(xué)及生物制藥應(yīng)用經(jīng)理劉先明
報告題目:timsTOF SCP帶您突破單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究極限
布魯克.道爾頓中國區(qū)蛋白質(zhì)組學(xué)及生物制藥應(yīng)用經(jīng)理劉先明做報告,基于單細胞層面的研究為生物系統(tǒng)中細胞間的同質(zhì)性和異質(zhì)性提供了更精準(zhǔn)的信息,隨著蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,檢測技術(shù)和靈敏度的提升,使實現(xiàn)單個體細胞的蛋白質(zhì)組學(xué)分析成為可能。單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)存在諸多挑戰(zhàn),比如樣本量少、樣本制備和質(zhì)譜靈敏度等。布魯克自2017年推出timsTOF Pro以來不斷發(fā)展,今年推出timsTOF Pro 2和單細胞分析的timsTOF SCP。在回顧了TIMS的原理和硬件設(shè)計后,他展開介紹了單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)方案和硬件特點,包括Evosep One LC、timsTOF SCP質(zhì)譜系統(tǒng)、一站式樣本前處理系統(tǒng),舉例了pg級樣本分析的結(jié)果。從Matthis Mann去年發(fā)表的最早文獻講起,介紹了單細胞定量蛋白質(zhì)組學(xué)方案。除了單細胞蛋白質(zhì)組學(xué),timsTOF SCP未來的應(yīng)用還包括單細胞的翻譯后修飾分析、免疫肽組學(xué)分析等。
上海交通大學(xué)生物工程學(xué)院丁顯廷教授
報告題目:微量細胞(單細胞)尺度的多組學(xué)檢測技術(shù)
丁顯廷教授介紹了課題組兩方面的研究工作。在非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)研究方面,介紹了微流控類器官方面的應(yīng)用,可以人工定制類器官。課題組發(fā)明了Dual-Flip技術(shù)和Tri-Flip技術(shù),研究腫瘤發(fā)展、轉(zhuǎn)移過程中的細胞三維變化,闡明了質(zhì)譜精度的提高對研究非靶向單細胞蛋白質(zhì)組非常有幫助。在靶向蛋白質(zhì)組學(xué)方面,課題組研究了元素同位素標(biāo)記結(jié)合ICP質(zhì)譜的方法,發(fā)現(xiàn)了稀有細胞族群,并介紹了銀屑病等臨床研究的成果。
景杰生物蛋白質(zhì)組學(xué)研發(fā)總監(jiān) 顧宏博 博士
報告題目:“真于心、單于一”基于質(zhì)譜的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)
單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究可在最基礎(chǔ)的維度上揭示生命現(xiàn)象,包括器官、組織、腫瘤的細胞組成異質(zhì)性;揭示相同細胞在不同發(fā)展時期的獨特特征、以及同類細胞在不同區(qū)域呈現(xiàn)的不同功能;在單細胞水平上,蛋白質(zhì)與mRNA在表達量上仍只有弱相關(guān)性。基于單細胞中蛋白質(zhì)組與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的弱相關(guān)性,有很多基于抗體的單細胞蛋白質(zhì)組分析方法;而基于質(zhì)譜的單細胞蛋白質(zhì)組分析方法大大提升了鑒定深度,比如Matthis Mann發(fā)表的單細胞蛋白質(zhì)組文獻一次定量1200個蛋白。景杰生物提供多種單細胞蛋白質(zhì)組分析方法,如非標(biāo)記單細胞蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析,可定量1個Hela細胞中超過1000個蛋白,100個Hela細胞中超過4000個蛋白,內(nèi)測數(shù)據(jù)顯示1000個Hela細胞3次鑒定的重復(fù)性很高。此外,還可采用LCM激光捕獲纖維切割技術(shù)鑒定不同大小腫瘤組織中的蛋白??偨Y(jié)來看,景杰生物提供系統(tǒng)的單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù),包括樣本制備、為單細胞定制的色譜質(zhì)譜系統(tǒng),以及附加的細胞分選、顯微切割、HE染色等服務(wù)。